در حالی که چندی قبل دیوان عدالت اداری، در حکمی مصوبات شورای عالی انقلاب فرهنگی را در حکم قانون ندانسته بود، رییس قوه قضاییه به واحدهای قضایی اعلام کرد: هیچ مرجع قضایی حق ورود به دعاوی مربوط به ابطال یا نقض مصوبات شورای‌عالی انقلاب فرهنگی را ندارد. حجت‌الاسلام محسنی‌اژه‌ای، رییس قوه قضاییه در تاریخ ۱۳ آذرماه ۱۴۰۳ بخشنامه‌ای صادر کرد که به‌موجب آن، مصوبات و تصمیمات شورای‌عالی انقلاب فرهنگی از اعتبار و الزام قانونی برخوردار است و مراجع قضایی موظف به رعایت این مصوبات هستند.
بر اساس این بخشنامه که در راستای دستور صریح مقام معظم رهبری (مدّ ظلّه العالی) صادر شده است، کلیه مراجع قضایی، اعم از دیوان عدالت اداری و دادگاه‌ها، از رسیدگی به دعاوی مرتبط با ابطال یا نقض مصوبات و تصمیمات شورای‌عالی انقلاب فرهنگی منع شده‌اند.
محسنی‌اژه‌ای در این بخشنامه تأکید کرده است که مصوبات شورای‌عالی انقلاب فرهنگی که با امضای رییس‌جمهور و رییس شورای‌عالی انقلاب فرهنگی ابلاغ می‌شوند، لازم‌الاجراست و هیچ مرجع قضایی از جمله دیوان عدالت اداری و دادگاه‌ها، حق ورود به دعاوی مربوط به ابطال یا نقض مصوبات و تصمیمات آن شورا در هر مرحله‌ای از رسیدگی را ندارد. همچنین، رؤسای‌کل دادگستری استان‌ها مسئولیت نظارت بر اجرای صحیح این بخشنامه را به‌عهده دارند.
این تصمیم با هدف تقویت جایگاه حقوقی و اجرایی شورای‌عالی انقلاب فرهنگی و جلوگیری از تعارض‌های قضایی با مصوبات این نهاد اتخاذ شده است.
